La storia si svolge negli anni '30 e ruota tutta attorno alla ricerca dell'Arca, antico manufatto della ormai quasi estinta popolazione dei Sirius con il potere di dare equilibrio al mondo: una sfera che può rendere dio o demonio, originariamente donata ai Sirius da un essere la cui natura non verrà tuttavia mai precisata e da lì in poi custodita da un loro membro eletto tramite oracolo. Si scoprirà trovarsi nell'isola di Sachalin ed essere stata lì sigillata da ormai qualcosa come 5000 anni, momento della sua ultima manifestazione. I Sirius, come visti in un flashback di tal periodo, sono una popolazione pacifica, simile come architetture, usi e costumi ad Inca ed Aztechi; vivono presso Dogville; la loro organizzazione consiste di un collegio di anziani che prende le decisioni principali incluse quelle relative all'Arca di cui custodiscono un sillabario ed un libro.
Alla ricerca del manufatto si pongono diversi gruppi: la Compagnia di Spedizione V di cui fanno parte il protagonista Yurii, il capo saggio Willard, Dorothea e le sue frecce letali, Philip il forzuto e altri ameni personaggi dalle doti combattive piuttosto rilevanti; i Servizi Speciali Arvin della Polizia Japponica con in prima linea il Maggiore Iba che sembra collaborare in qualche misura con i protagonisti; la Società Commerciale Alma che vende allegramente armi e compie ricerche sugli umanoidi a tempo perso; il Clan dei vampiri, gli antagonisti, con a capo Lord Yevgraf vecchio di un secolo che si servirà nel corso della storia anche del Clan Hyakko, in sostanza un gruppo di fautori della Restaurazione dell'Era Imperiale dominata dai Samurai che si diletta a fare del sano terrorismo a pagamento potendo contare tra l'altro proprio su un umanoide tipo Frankenstein per gentile concessione di uno sfigurato scienziato le cui ricerche saranno ripudiate proprio da Lord Yevgraf.