Kei Nagai è uno studente modello delle superiori, impegnato nello studio per gli esami scolastici, in cui conta di prendere ottimi voti per garantirsi l’accesso a un’università prestigiosa. Un giorno, nel tragitto da casa a scuola, mentre attraversa la strada, viene investito in pieno da un camionista distratto, sotto gli occhi inorriditi di tutti gli altri passanti. Passanti che restano ancora più increduli e spaventati quando, pochi secondi dopo, vedono uno strano alone scuro avvolgere il corpo di Kei, che giace senza vita sotto le ruote del camion. Nel giro di pochi istanti, il ragazzo, un po’ intontito, ma apparentemente in buona salute si rialza guardandosi attorno confuso. Kei è un Ajin, esseri semi umani, apparentemente immortali o quasi, capaci di resistere a qualunque ferita ed addirittura di sopravvivere alla propria morte. Scoperti durante un conflitto in terra africana circa vent’anni prima, gli Ajin, esseri tanto rari quanto misteriosi, sono perseguitati e cacciati dalle autorità di tutto il mondo, sia perchè visti come una minaccia, a causa della loro incredibile abilità, sia per essere studiati e analizzati come cavie da laboratorio. Terrorizzato e confuso, Kei scappa con l’aiuto di un vecchio amico d’infanzia, dando il via ad una serie di eventi imprevedibili: al ragazzo non sono infatti interessati soltanto poliziotti e autorità governative, ma anche una misteriosa organizzazione di Ajin terroristi che punta a combattere la società umana colpevole di averli perseguitati.